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No primeiro semestre de 2020, prefeituras de 15 cidades do Vale do Paraíba receberam R$ 12,8 milhões da CCR NovaDutra. O valor é referente ao ISSQN (Imposto Sobre Serviço de Qualquer Natureza), repassado anualmente às prefeituras, oriundo das praças de pedágio instaladas na rodovia.
O recurso é dividido entre as cidades de acordo com a participação de limite territorial, ou seja, com a quilometragem voltada para a rodovia. Não há repasse com fórmula diferenciada (adicional) para os municípios que abrigam as praças de pedágio.
A Concessionária explica que a alíquota de 5%, hoje vigente para todos os municípios, não é determinada pela CCR NovaDutra, mas pelas legislações fiscais dos próprios municípios. Desde 2000, quando passou a vigorar a nova Lei do ISSQN, foi recolhida a quantia de mais de R$ 866 milhões aos 36 municípios próximos à rodovia.
Valor de ISSQN repassado aos municípios:
| Município | Valor do ISS* |
| Jacareí | 1.280.390,89 |
| São José dos Campos | 1.731.088,48 |
| Caçapava | 1.074.796,71 |
| Taubaté | 1.194.787,62 |
| Pindamonhangaba | 1.404.040,07 |
| Roseira | 596.296,33 |
| Aparecida | 599.954,58 |
| Guaratinguetá | 795.305,65 |
| Lorena | 542.154,09 |
| Canas | 450.697,60 |
| Cachoeira Paulista | 687.752,82 |
| Cruzeiro | 410.456,73 |
| Silveiras | 186.571,24 |
| Lavrinhas | 755.064,81 |
| Queluz | 1.110.647,65 |
| Total | 12.820.005,27 |
